Das jeweilige Jahresforschungsprogramm umfasst Projekte, die als einzelne Themenvorschläge von den Gesellschaftern des AIHTA eingebracht oder im Rahmen von Programmlinien − dazu zählen Bewertungen medizinischer Einzelleistungen (MELs), der AIHTA-Informationsdienst Rapid Reviews sowie Berichte für das Bewertungsboard − erstellt werden. Zudem beinhaltet es eigendefinierte und Drittmittel-Projekte.
