Das AIHTA nahm im März 2020 als Nachfolgeinstitution des Ludwig Boltzmann Instituts für Health Technology Assessment (LBI-HTA) seine Tätigkeit auf. Gemeinsam mit der Vorläuferinstitution blickt das AIHTA inzwischen auf 20 Jahre Erfahrung in der wissenschaftlichen Bewertung von Gesundheitstechnologien zurück.
Gemäß seinem Gesellschaftsvertrag verfolgt das AIHTA das Ziel, unabhängige, transparente und interdisziplinäre wissenschaftliche Unterstützung der Entscheidungsträger:innen und Verwaltung des österreichischen Gesundheitssystems zu bieten. Die Forschungsaktivitäten erfolgen ohne Gewinnerzielungsabsicht; die Gesellschaft verfolgt ausschließlich und unmittelbar gemeinnützige Zwecke.
Das AIHTA verfügt über ein Jahresbudget von 2.487.180 EUR (Stand 2025), das hauptsächlich von seinen elf Gesellschaftern getragen wird: dem Dachverband der Sozialversicherungsträger (DVSV), den neun Bundesländer und ihrer Gesundheitsfonds sowie dem Bundesministerium für Arbeit, Soziales, Gesundheit, Pflege und Konsumentenschutz (BMSGPK). 147.035 EUR konnten an Drittmitteln aus nationalen und europäischen Forschungsprojekten eingeworben werden.
Derzeit beschäftigt das AIHTA 30 Mitarbeiter:innen (entspricht 26,35 Vollzeitäquivalenten). Davon sind 80 Prozent wissenschaftlich tätig.